研究與評測
Google DeepMind 以 Antigravity 協助找出新抗菌肽候選分子,已進入濕實驗驗證
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本次未取得足夠原文證據
Google DeepMind 介紹其代理式開發平台 Google Antigravity 在抗菌肽(AMP)探索上的應用。文章指出,抗藥性上升可能到 2050 年每年造成約 1,000 萬人死亡,因此需要新的療法。研究團隊以 Antigravity 作為代理式科學工作台,讓生物學家在單一工作階段內完成原本需跨多個資料庫的篩選、結構評估與優先排序。
此案例中,研究者與 AI 代理設定目標為在 Streptococcus pseudopneumoniae 中尋找並以計算方式驗證新的 AMP。研究者負責決定研究策略與要收集的證據,代理則處理跨資料庫整合、結構分析與文獻彙整。最終找出的候選分子,預測對引發呼吸道感染的病原體具活性,目前正在進行濕實驗驗證,文中未公布實驗結果。
另一項技術是 ProtNLM(Protein Natural Language Model),DeepMind 表示此深度學習模型可直接從胺基酸序列預測生物功能,用以為 UniProt 中數百萬個先前未註解的條目補上功能標籤。文章同時介紹嵌入 Antigravity 的 Biomolecular Structure Viewer 三維結構視覺化工具,代理可調用 AlphaFold Database 的結構並標示關鍵區域,研究者也可在三維結構上標記殘基或結合口袋,讓代理據此推理。
讀原始報導背景
UniProt 是一個免費開放的蛋白質序列與功能資訊資料庫,許多條目源自基因組定序計畫,由多個歐洲生物資訊機構組成的聯盟維護。蛋白質體學(Proteomics)則是大規模研究蛋白質的領域,探討生物體所產生或修飾的全部蛋白質(即蛋白質體)的組成、結構與活性。