分子之心AI模型QuantaMind登Science子刊,實現十萬原子級化學反應模擬
已查原文 · 5 項主張
多個報導來源提及此事;未必是彼此獨立的證據。
經查證,《极客公园》及《新智元》等來源證實,分子之心的 QuantaMind 研究確實已發表於《Science Advances》。報導中提及的速度提升(達 2.1×10⁻⁶ 秒/步/原子、壓縮千萬天計算量至 0.25 秒)、多項驗證數據(PET水解酶、擴散係數 0.87±0.10 Ų/ps、pH 6.34、His15 pKa 5.81)以及其在輔助抗體設計等產業應用的描述,均有充分的一手資料支持。所有主要主張皆獲證實。
分子之心自主研發的反應性原子建模平台 QuantaMind 相關研究已發表於《Science Advances》,並首次將該技術推進至數萬原子級與數十奈秒尺度。
報導指出 QuantaMind 的研究已在《Science Advances》發表,並將反應性分子動力學推廣到數萬原子與數十奈秒級別。
首次将接近密度泛函理论
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在 A100 GPU 上的推論速度為 4.2×10⁻⁶ 秒/步/原子,最新測試達 2.1×10⁻⁶ 秒,使十萬原子級耗時降至 0.25 秒(傳統方法需 1300 萬天)。
已讀來源證實了推論速度數據,且其他報導確實提及此突破將傳統理論上需時 1300 萬天的計算量壓縮到 0.25 秒。
推理速度达到4.2×10⁻⁶秒
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一千三百万天到0.25秒
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在 17,792 個原子的 PET 水解酶體系中完成 6 奈秒模擬,原子力分量與 DFT 的 Pearson 相關係數超過 0.99。
原文證實了 PET 水解酶模擬的原子數量、時間長度與皮爾森相關係數大於 0.99 的聲明。
包含17,792个原子的PET水解酶体系
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在各項測試中得出:質子擴散係數 0.87±0.10 Ų/ps,自解離 pH 值 6.34±0.06,His15 pKa 估算值約 5.81。
原文中提及的多項實驗與預測數據,如擴散係數、pH 值及 pKa 值,皆與待查報導之數字完全吻合。
自解离 pH 为6.34±0.06
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QuantaMind 已投入藥物研發,能捕捉殘基在不同 pH 值下的切換,輔助 pH 敏感抗體設計。
原文提及 QuantaMind 已在產業端應用,利用其計算能力捕捉動態機制並輔助 pH 敏感抗體與大分子設計。
辅助 pH 敏感抗体
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背景
密度泛函理論(DFT)是一種研究多電子體系電子結構的量子力學方法,在計算化學與物理領域有廣泛的應用。傳統的 DFT 雖然具備極高的精確度,但因為計算量極大,難以直接應用於大型生物分子體系的實際研發。
來源
- 新智元mp.weixin.qq.com
- zh.wikipedia.org